霍少屿被属下背叛而死,消息传到皇城,女主听了后吐血,丽妃陷害女主和男主有私情,皇上直接宣布刺死皇后,并且把女主的儿子送去做质子。女主凄厉挣扎丽妃靠在女主耳边表示,自己喜欢男主很多年了,都怪你害死了她,直接被暗卫捅死。现代重生。。刚从美国回来的周勤想回国发展自己的事业,来到了昔日教授刘子纯任职的永盛集团,担任了证券部经理一职,并偶遇了已与吴刚相恋的前女友曼芳。然而,周勤上任不久,财务总监贺子欣自杀了,而调查此案的正是周的情敌吴刚。因为周颇得总栽的赏识,遭到了副总栽陈权的嫉妒。陈权带了新的秘书KACY来参加舞会,并让KACY去接近周勤,这时,吴刚突然出现,带走了刘子纯协助调查贺子欣自杀一案。。2000年,一个科学探险队在南极洲针对被称作“第一使徒”亚当的“光之巨人”进行探险。在对其进行接触实验时,“光之巨人”自毁,从而发生了“第二次冲击”,进而导致世界大战。最后,人类人口减半,地轴偏转、气候改变。根据对“第二次冲击”的调查,联合国在日本箱根成立人工进化研究所(即GEHIRN)从事EVA(指机器人)的发展研究,后GEHIRN利用在人工进化研究所下方发现的巨大空洞建造了总部。
另一方面,联合国下属秘密组织SEELE为了使人类进化,开始实行人类补完计划,就是将所有人的灵魂汇集在一起,通过中和每个人的AT力场,使每个人回归LCL之海。
2004年,EVA初号机进行启动试验时发生事故,碇真嗣的母亲碇唯消失,碇源堂开始执行“碇源堂版本的人类补完计划”。2010年,GEHIRN被改建成NERV。
2015年开始,根据SEELE人类补完计划剧本的安排,一种不明巨型生物“使徒” 开始在日本登陆,并向NERV总部进攻,NERV组织EVA消灭使徒。在NERV与使徒作战的同时,碇源堂秘密地执行它自己的计划。随着时间推移,碇源堂 的计划逐渐被SEELE发现,NERV与SEELE产生了矛盾并不断恶化。这一矛盾在电视版中没有得到解决。在剧场版中,NERV于SEELE的矛盾激 化,SEELE派出军队进攻NERV,在占领了NERV后发动了第三次冲击。全人类全部化为LCL之海,只有碇真嗣和明日香留了下来。。