一天,工藤大器偶然听到了神秘声音的呼唤,与朋友们一起来到了数码世界,在那里认识了众多的数码兽同伴并且成为指挥官建立“Xros Heart”团队。意想不到的是,在数码世界中除了他们外竟然还有别的人类在数码世界中活跃着……然而,为了防止邪恶的巴古拉军企图称霸数码世界,他们将要努力地收集水晶(Code Crown)来保护各个领域(Zone),担负起拯救数码世界的命运。 被巴古拉兽击回到人类世界的工藤大器和高吼兽,经过东京大决战留在人类世界一天后,相对地数码世界已经过了好几个月的时间,并落入了巴古拉军支配下的地狱世界,分裂为七个国家(Land),由七名巴古拉军手下的死亡指挥官所统治,而这七名死亡指挥官就是本篇章的主要敌人。为了让数码世界再次得到和平,工藤大器和高吼兽决定再次回到危机四伏的数码世界中。此外,本篇章亦出现全新力量“超进化”。 与巴古拉兽的最终决战...。全椒县儒生方林,因恋人遭同乡吴嵩觊觎,在乡试中惨遭陷害。
此后方林屡试不第,爱人小玥更是遭吴嵩所夺。方林心灰意冷,躲在私塾中潜心教学,只求能平安了此残生,却因为四个充满正义感的年轻人和一桩乡试弊渎案,再次被卷入了吴嵩的阴谋之中。
此时吴嵩已官拜大学士,权势熏天。为了世间正义,方林与知府徐天佑携手,带领四名热血青年,向着阴谋最深处发起挑战,这一次方林发誓绝不会退缩半步····。