零一没有结束——灭亡迅雷站,复活!哉亚公司的CEO——里昂亚克兰德,掳走了灭亡迅雷站的迅。灭、亡还有雷想要去救迅,却看到了大量的“士兵型修码吉亚”。里昂的目的是大规模生产没有自我意识的“士兵型修码吉亚”,把他们当成武器,卖往全世界各国。修码吉亚将被当成武器利用,迅对这一事实感到愤慨,并告诉灭他想解救这些修码吉亚。于是灭亡迅雷站的四人,变身成了假面骑士,为救出“士兵型修码吉亚”而战斗。但就在那时,迅突然有些不对劲...被里昂俘虏的迅到底经历了什么?一切都按照里昂的“计划”进行着,对人类而言的“最大威胁”,将以令人意想不到的方式诞生。。故事开始于1937年的北平,纷飞的战火之中,童话和古城出生了。童话是自小被养在深闺之中的王府大小姐,不知道一墙之隔的外部世界正在发生怎样翻天覆地的变化。古城则早早失去了父母,独自伶仃飘摇,历尽人情冷暖,是个彻头彻尾的野孩子。
命运让童话和古城相遇了,两人虽然个性迥异,但却相互吸引。古城父母的革命战友洛秋找到了古城,收养了他,古城开始和洛秋的儿子洛栓子生活在同一屋檐下。之后,洛秋将古城送进了学校,在学校里,古城结交了王小勇,巧合的是,王小勇的父母和古城的父母,亦是旧相识。。暗黒紐宇宙にある「キョアック星」はこれまで宇宙の多くの星を侵略し、配下に収めてきた。そしてその魔の手は地球にも差し迫っていた。ちょうどその頃、国分寺博士はオーバーテクノロジーを持つ「超古代縄文人」がキョアック星人の侵略を予期して描いたという巨大ロボットの壁画をもとに、合体ロボット「ゲキ・ガンガー3」を作り上げた。地球の緑を守るため、ゲキ・ガンガー3はキョアック星人の「メカ怪獣」と死闘を繰り広げる…。。