故事紧接《科学怪人》结尾火烧科学怪人场面,弗兰肯斯坦和他制造的科学怪人都活了下来,科学怪人并没有像博士想象的那样杀死……弗兰肯斯坦决定洗手不干,但另一位疯狂的科学家怪博士找到弗兰肯斯坦要合作造个女人,并绑架他的妻子作为威胁。弗兰肯斯坦只好答应。科学怪人逃生后,历经险阻最终与怪博士相遇,三人在古堡中期待科学怪人的新娘诞生……。两年前,包拯忽接到一封信,便急急离开家园,之后便音讯全无。这些年里,每当有奇案发生,公孙策便会赶赴现场,目的其实是为了寻找包拯。因公孙策谙辽语,仁宗遂委公孙策为礼部侍郎,前往宋辽边境洽谈议和。在边境小镇,公孙策和展昭遇到了大包——失去记忆成为妓院小杂工的包拯。失忆后的包拯傻里傻气,常被妓院里的小丫鬟小蛮欺负。妓院老板及辽国大官相继神秘被杀,包拯找到了真凶,真凶欲杀包拯灭口,但他却因祸得福恢复了记忆。
公孙策领着包拯及小蛮回到京城,得仁宗召见。仁宗邀得东瀛高僧至中土论道,派包拯代替自己前往参神。东瀛高僧带来了神武天皇传下的三大神器,有传闻神武天皇,正是当年被秦始皇派往东海寻找神仙的徐福。守护三大神器的僧人相继被杀,包拯终破了此案,同时,亦参悟出三大神器的秘密。原来,内里藏有一地图,可寻到宝物天芒。仁宗认为天芒很可能就是徐福当年给秦始皇炼制的长生不死药,包拯得皇命寻找天芒,遂领着小蛮、公孙策及展昭上路了。
路途中,包拯等人结识了占卜姑娘小风筝、庞太师之子庞统和谜之少女若水等人。最后包拯才发现,这一切好像都是一个圈套,不管是自己的失忆,还是心之所系的小蛮……。