幼时的张平和张安,跟着妈妈王凤霞卖鱼为生,但却总因王凤霞手臂上的疤痕导致被人误解有传染病,以致生活艰难。因为张安从小过敏,张平认为妈妈总是偏心更爱弟弟,心生嫉妒,在和张安争吵中,意外导致张安掉落山下,不知所踪。。秦府千金秦晚清和母亲被凤凰男父亲的新晋妾室杨曼汐赶出家门,杨曼汐为绝后患雇凶将二人杀害并丢至井中。此时恰逢现代都市女霸总“秦晚清”穿越而来,女霸总答应原主的复仇请求,以身入局,亲自上演复仇大戏。。神秘的EVA零号机驾驶员绫波丽,在与碇元度约定之时,来到了NERV底层中央教条的红色水池边。她的命运似乎就将在此结束。
在危急时刻,葛城美里不但要完成加持良治交待的对“第二次浩劫”真相以及“人类补完计划”的探查工作,还要保护碇真嗣与明日香,以及防备SEELE 对初号机与二号机的物理接触。
出于对碇元度的憎恨,赤木律子接受了SEELE引爆MAGI的提案,她能否成功?长期与SEELE共事的碇元度、冬月耕造、碇唯,为了防止人类“最终的悲剧”,而酝酿了的“人类补完计划”能否实现?尽在《新世纪福音战士》电影版第2部中解答。。