明朝万历初年,朝中都察院左都御史丁淮之全家被灭门,只有女儿丁蝉儿逃生。 正当太原府总捕头萧长风逐渐查出真相的时候,却被知府段世骧诬为乱党,萧长风护着丁蝉儿踏上了亡命之路。。神奈川新机场被用面具遮住脸的武装团体“兽”占据。再次被卷入事件的武藏,向1年前的事件以来,休职中的管理官·和泉樱请求协助。情报分析官志摩和新的朋友也加入其中,从机场救出人质,“消灭”比前作的“鬼”更危险的“兽”。另一方面,在横浜湾医院握手术刀的武藏的妻子心脏内科医生裕子也被卷入了某个事件。解救人质的期限只有一天。“兽”们的真面目、目的、还有武藏家的命运是什么呢?。1942年,日本侵略者对重庆的大轰炸已经进入了第四个年头。侵华日军总司令冈村宁次意外地得到一个情报:在重庆西南的古刹华岩寺中藏有一件镇寺之宝——《贝叶金经》,在这部经书中还隐藏了一个惊天秘密。如果得到了这个秘密就可以让日军轻而易举的消灭整个国民党政府,以实现其占领全中国的狼子野心。为了得到《贝叶金经》,冈村宁次精心策划了一次代号“阿波罗”的作战行动,他特别派遣了由日本浪人组成的日军王牌特工队“樱花小组”秘密潜入重庆,偷偷地把黑手伸向了西南第一古刹——华岩寺。通过各种渠道得知日军特工潜入重庆的消息后,为了粉碎日寇的阴谋,中共地下党组织、国民党中的爱国人士与华岩寺众僧侣与“樱花小组”展开了殊死搏斗,最后他们用鲜血和生命终于将《贝叶金经》完好无损地保护了下来。。