1992年,日政府在关西的筑波建立国际哥斯拉对策中心。世界科技精英共聚一堂,合力研究一部G超武器—机械哥斯拉。以大前博士为首的考察团到达亚度诺亚岛时,发现了一只完整无缺的蛋。当团员把蛋带回京都时飞翼龙拿顿出现并攻击考察团一行人。这时哥斯拉亦在亚度诺亚岛出现,两只怪兽由海上战斗到陆上……。故事发生在1932年的日本,年轻的灯塔员有泽四郎(佐田启二饰)带着刚刚成婚的妻子清子(高峰秀子饰)来到了位于东京湾的观音崎灯塔赴任。之后,清子为丈夫生下了两个孩子雪野(有泽正子饰)和光太郎(中村嘉葎雄饰)。灯塔守塔员的日子非常的清贫和枯燥,但是四郎和家人们在一起,还是感到十分的幸福。 1937年,四郎一家人转移到了一座荒岛上,驻守在那里的女岛灯塔中,随着时间的推移,夫妻两人之间的争吵越来越多,感情出现了裂痕。之后,四郎一路从一名小小的守塔员,最终攀登到了职业的顶峰——灯塔长,在此过程中,他收获了很多,但是也失去了更多。。