某天,小新闲逛的时候捡到一个动感超人的面具,戴上面具后,小新发现自己竟然能和动感超人通话。他被任命为代表正义的动感间谍,专门与邪恶势力作战,并且见到了他的搭档——7岁女孩苏诺萌·柠檬(爱河里花子 配音)。在柠檬的带领下,小新开始作为动感间谍的艰苦训练。在这一过程中,面向凶恶的怪大叔不断偷袭小新,而在这一系列事件背后,似乎又隐藏着两个神秘的国家——无声屁共和国与不放屁王国。看似善良的柠檬也变得正邪难辨。不久,小新更和柠檬闯入了困难重重的不放屁王国……。目暮警官、毛利兰的母亲妃英理以及阿笠博士接连遭到不明身份之人的暗算。江户川柯南开始追踪伤害了阿笠博士的犯人,他根据几起案件现场留下的线索,发现犯人是按照扑克牌的顺序来行凶的,而且遇害者都是与名侦探毛利小五郎有关的人。目暮警官提供的线索初步揭开了事情的真相,原来毛利小五郎当年任职警察的时候,曾经逮捕了犯下杀人罪的赌徒村上丈,当年也因为这一事件导致毛利小五郎离职以及婚姻变故。十年后,服刑期满的村上丈出狱了,他开始按照扑克牌的顺序向毛利小五郎身边的人展开报复。
在得知了事情的原委后,毛利小五郎努力寻找身边有什么人与数字有关。在这一过程中,各种惊险的场面接连出现。然而江户川柯南也开始对案件的真相产生了疑惑……。生活在2037年的6262一天在与丈夫吵架后开快车,不慎撞入了时光隧道。眼前奇怪的景象让她不知身在何处,随后她便认识了经营糖果厂的方中信,她才知道原来自己回到了50年前的1987年。
6262化名陆宜,暂住在方中信家中。为了可以顺利回家,陆宜把自己的身世告诉了方中信,中信也答应帮她找科学家设法让她到2037年。陆宜在这里看到了自己母亲的童年,她对不幸的母亲非常怜惜。原来,陆宜是随时可以回去的,只是因为方中信已经爱上了她,想她能多陪在自己的身边。
陆宜还是想念自己在2037年的孩子的,而且属于陆宜世界中的政府开始有所行动了。。