主人公の少年ユウキ・コスモら地球人が移民したソロ星で、第六文明人の遺跡が発掘された。遺跡の文献からフォルモッサ・シェリルが導き出した名を取り、発掘された巨人ロボットはイデオンと呼ばれるようになる。 そのイデオンは、異星人バッフ・クランの伝説でイデの巨神として語り継がれていたものだった。イデ捜索隊隊長のギジェ・ザラルに無断で、カララ・アジバが調査のためにソロ星(ロゴ・ダウ)へ向かう。 コスモ、ジョーダン・ベス、イムホフ・カーシャがイデオンを操縦するが、二つの人類は双方とも相手を異星人と呼び、恐れ、自分の星を守るために異星人を殲滅しようとして戦火を拡大させた。 コスモ達はソロ星を捨て、イデオンの母船ソロシップに乗って宇宙を逃亡する。。摄影师増岡(塚本晋也 饰)性格压抑,对人类的恐惧有浓厚的兴趣。一日他凑巧拍下了陌生男子阿礼在地铁刺瞎自己的右眼,増岡反复研究录像,并为实地考察阿礼自残的原因回到现场,他从地铁的设备管道深入地下,惊见已经泯灭的地下文明遗址,并带回一名被锁在遗迹中的赤裸女子。
増岡称女子为“F”,自此他和F同居一室,并每天工作时借视频手机观察F的举动,F不吃不喝,生命逐渐垂危。増岡偶然发现F吸食血液,于是割伤自己为其续命,不久増岡即发展到杀害陌生女人取血的地步。但F在人类世界难以生存,逐渐麻木的増岡在同F的关系中体味到了真正的恐惧……本片获2005年布鲁塞尔国际幻想电影节金乌鸦奖。。