一隊探險家試圖到達一座偏遠、未經探索的火山頂部尋找答案,以解開火山噴發時間以及噴發原因的謎團。。伊藤修司(冈田义德 饰)和吉田浩之(草野康太 饰)是在同一个班级里学习的同学兼好友,实际上,修司对浩之一直存有着超越了友谊的感情,他选择将这份懵懂的感情默默隐藏在心底。浩之和同班的清水彩子(高野久实 饰)正在交往,虽然彩子个性温柔又开朗,但浩之始终觉得两人的关系里透着一种疏离。
原果沙间(滨崎步 饰)饰班级里的“异类”,喜欢独来独往,她特立独行的气质渐渐吸引了浩之的注意。与此同时,修司再也无法压抑心中的感情,对浩之告白了,面对好友真诚的表白,浩之不知道该做出怎样的回应。沙间失踪了,浩之和修司结伴前往她在海边的老家寻找她。。在不远的未来,海平面原因不明地急速上升,导致了地表多数都沉入海中。 小时候因为事故而失去一条腿的少年・斑鸠夏生,厌倦了都市的生活,移居到了海边的乡村小镇。曾经身为海洋地质学家的祖母留给他的、就只有船、潜水艇还有债务。 夏生为了取回“失去的未来”,与迷之讨债人凯瑟琳一起,潜海前往据说保存着祖母遗产的海底仓库。 在那里,他遇到了一位沉睡在如同棺材一般装置中不可思议的少女“亚托莉”。她是一位构造精密到与人类别无二致,而又丰富感情的机器人。 从海底被打捞起来的亚托莉如是说到: “我想完成主人留给我的最后的命令。在此之前,我会成为夏生先生的腿!” 在一个逐渐沉入海中的平和小镇,少年和机器人少女的难忘夏日就这么开始了。。