消防员从一家被大火烧毁的“虚拟空间工厂”的废墟里救出了身受重伤的乔布,此时的他处于奄奄一息的状况之下,并且失去了过去的所有记忆,由于过度烧伤,医生还对他进行了整容手术,醒来后的乔布已经完全失去了从前的面貌。但沃克带领的正从事虚拟空间研究的“虚拟空间研究所”却已经暗中盯上了乔布,他们对乔布进行了虚拟现实实验,以此来帮助他重建了思想,最终借助他的力量来实现不可告人的目的。
时间来到未来的洛杉矶。彼得和特拉维斯、哈维、肖恩等几个小伙伴住在城市地下的隧道里,过着流浪的生活,几个人都酷爱网络虚拟游戏,在一次进入虚拟空间时,彼得竟然遇到了乔布,两人相见甚欢,乔布告诉彼得自己被困在了虚拟空间,而网络虚拟空间即将毁灭,他也会随之消失,只有一个叫本杰明?特雷斯的人能够救他,恳求彼得帮他找到特雷斯并将他带到虚拟空间里。彼得一口答应,但找到特雷斯后却发现那是个十足的怪人,他隐居在人迹罕至的戈壁,对陌生的彼得并不友好。直到彼得提到奇容芯片的事,他才答应前往。二海堂昶(小野大辅 配音)是个性格孤僻不爱上学的不良少年,在一次逃学的路上,昶遇见了一位行事神秘的黑衣男子。男子名叫白银(诹访部顺一 配音),他告诉昶,自己和昶有着不可分割的羁绊,并和昶约定晚上十时在校舍见面。昶并不将此当做一回事,但令他没有想到的是,通过这次见面,一个光与影的新世界展开在了昶的面前。
在校舍,昶遭到了神秘怪物的袭击,虽被白银所救,但昶却永远的失去了自己的影子。为了保持自己的存在感,昶与白银签订了契约,白银成为了昶暂时的影子。之后,被成为“黑魑”的怪物不断的骚扰着两人,而昶也被卷入了一场影子的争夺战之中。。