帝国历486年,因好友莱茵哈特·冯·缪杰尔即将迎来继承罗严克拉姆家族姓氏的重要时刻,需对该家族的历史情况有一个了解,因此难得迎来假期的齐格飞·吉尔菲艾斯只得只身前往人造卫星克罗伊兹奈哈3号度假。这个出身平民阶层的耿直男孩似乎无法融入当地奢靡享乐的气氛之中,正在苦恼之际,他从一位疯狂男人的刀下救下了一名老人。老人名叫凯萨林克,曾是帝国中将,三年前因亚鲁列斯海姆星域会战惨败而背负污名,降职少将不久更被迫退役。 在接受警方闻讯过程中,吉尔菲艾斯得知疯狂男子与名为赛奥辛的毒品有关,而且许多军人也暗自牵涉其中。他不知不觉接受了署长调查毒品的委托,由此也在再次和凯萨林克男爵产生交集……。かつて、突如として現れた正体不明の敵・アンノウン。 「超進化鉄道開発機構」通称「ERDA(エルダ)」は、 対抗手段として新幹線が変形するロボット「シンカリオン」を開発し、脅威に備えていた。 「何かを守れる、カッコイイ人に…僕は…」 中学2年生の大成タイセイは、2年前に失踪した姉の手がかりを求めて、進開学園中等部に転入する。 その矢先、10年ぶりにアンノウンが出現。偶然にもタイセイがシンカリオン運転士として 高い適性値を持つことが判明し、闘う決断を迫られることとなる。 アンノウンの正体、そして目的は何なのか…。闘いの末に見えてきた真実とは…。 少年たちの決意と成長の物語が、今、始まる―。。