本动画由《座敷童子》《海坊主》《无脸怪》《鵺》《化猫》五个故事组成,背着一个大药箱、持着一把退魔之剑的卖药郎(樱井孝宏 配音)是每一个故事的联结者。妖怪的形成,是由人类的种种因缘引起的;要想拔出退魔之剑,就必须要凑齐“形、真、理”。“形”即由人的因缘所引起的妖怪的形态;“真”即事件的真相;“理”即当事人心里真实的想法。
雨夜里,一名怀孕女子来到旅馆投宿,老板娘将她安排到一个从不住人的房间里。同时,有个追杀此名女子的男人也来到旅馆。不久后,奇怪的事情发生了。卖药郎得知妖怪的“形”乃怨灵“座敷童子”,而“真”和“理”究竟是……在卖药郎的询问下,老板娘说出了多年的真相,原来这家旅馆的前身是青楼,而这个房间,竟然是……。宽永十五年,德川幕府打压天主教徒,导致爆发血腥残酷的岛原之乱。在这起事件中,约有两万名天主教徒惨遭杀害。及至深夜,满怀巨大仇恨的教众首领天草四郎时贞(沢田研二 饰)复活,他捐弃信仰,转生魔界,发誓报复幕府统治者。在此之后,他接连将细川夫人(佳那晃子 饰)的怨灵、濒临寿终却心存遗憾的宫本武藏(緒形拳 饰)以及宝藏院胤舜(室田日出男 饰)、遭遇灭族的伊贺忍者雾丸(真田広之 饰)拉入魔界,邪魔的力量陡然倍增。细川化身阿玉迷惑四代将军家纲(松橋登 饰),柳生但马守宗矩(若山富三郎 饰)有心除魔,无奈天不假年,更在弥留之际堕入魔道。柳生十兵卫(千葉真一 饰)成为铲除邪魔外道的最后希望……
本片根据山田风太郎的传奇小说改编。。