故事发生在名为霜科的高级中学里,有川姬(桑原由气 配音)是高中二年级的学生,他虽为男儿身,但生得娇俏可爱,因此常常被不明真相的群众误解。某日,有川姬遇见了纠缠不休的变态,不仅盗摄,甚至向外出售他的照片,就在有川姬焦头烂额之际,霜科高中学生会出现了。
就这样,有川姬加入了只有女孩子才能够加入的学生会,并且被规定只能穿女装出席。个性大大咧咧常常惹是生非的副会长步18禁(摩天楼由香 配音)、运动学业全能却很胆小的会长运子(小野早稀 配音)、毒舌中二的书记爱尔威尔缇娜2世(东城日沙子 配音),在这些“怪奇”少女们的围绕下,有川姬会遭遇怎样的命运呢?。故事讲述无聊的神明们制作了一个终极益智游戏《诸神的游戏》,从冰里长眠3000年,热爱游戏的前神明少女レオレーシェ苏醒后做出宣言,「带上这个时代最会玩的人!」,而被指名的フェイ是备受期待成为「近年最强的新人」的使徒,两人共同挑战难度极大且还没有人类能完全攻略的《诸神的游戏》。 天才游戏少年、前神明少女与伙伴们就此展开和至高神明的终极脑力大战!。身为教师的主人公,在儿子就读的学校里发现了一个来自过去的时间囊,时间囊中有一些图画文件之类的东西,上面写着对未来世界的预言。其中有一些现在已经实现,而另一些则有可能将要发生。最可怕的是,它预言地球即将毁灭,主人公被迫在有限的时间内采取行动,以阻止预言的实现。。