在人类的历史和传说中记载着许多妖魔鬼怪的故事,很少有人知道他们是真正存在的,而它们的本来面目竟然是一种植物生命体。日本传说中的荒神也是这种植物生命体。而传说中被从高天原流放的天照大神之弟须佐之男竟然是它们的首领。而传说中他从八歧大蛇口中所救的女孩奇稻田姬则是代代转生,专为封锁荒神而存在的巫女,一旦巫女不能够自然死亡,那么日本所有的荒神就都将在第一时间死亡,但巫女活着又会制约它们的力量。所以历代的奇稻田姬都会在当时政府的严密监护下生活,而荒神们几百年一成不变的矛盾就是又想杀死又不得不保护。 到了藤宫红叶这一代,问题发生了变化,继承奇稻田姬力量的是一对孪生姐妹红叶和枫,由于封印力量的减弱,荒神们又逐渐恢复了力量,而须佐之男竟然也开始慢慢复苏。荒神们制造了一个结界,准备在里面杀死红叶,以确保自身不受影响。但一个神秘的少年草雉,却打算在荒神动手之前抢先杀死红...。幸存者们发现岛上存在神秘建筑入口,在杰克(马修·福克斯 Matthew Fox 饰)的带领下进行探索,强制进入舱门后,发现里面竟然有人,且是杰克曾经在现实中有过一面之缘的戴斯蒙德(亨利·伊恩·库斯科 Henry Ian Cusick 饰),如同看到救星一般,戴斯蒙德留下一串数字密码便跑掉了,而杰克一行则需要接替他的任务——每隔108分钟输入密码以关掉警报。在舱门中,幸存者们找到充足食物,也由一卷录影带了解到这座孤岛的背景,似乎和某个失败的实验有关。另一方面,扎起竹筏试图离开岛屿的迈克尔(哈罗·佩里纽 Harold Perrineau 饰)等人并没有成功驶向深海,而是被潮水带到岛的另一边,发现还有一群机尾的幸存者,他们挟持着迈克尔等人慢慢向营地靠近……。