《黑狼行动之迷你侠》主要围绕主人公阿强(张强饰)的励志故事展开。据说阿强出生时,小山村上空电闪雷鸣,这赋予了阿强能放电的超能力,也因此阿强的身高永远维持在不足一米的高度。八岁的阿强在艺校里结缘阿娟(欧宇宁饰),两人相依练舞不离不弃。然而美好的时光总是短暂的,这对青梅竹马也在阿强进城发展后分别。 不料阿强所在的剧组惨遭黑狼(时晓飞饰)设计破产,阿强开始了颠沛流离的生活,而就在一次逃命中,阿强被伪装成道具师的特警教官三哥(张琼饰)搭救并收留。另一边,长大后的阿娟成了一名警察,奉命潜入黑狼身边寻找犯罪证据和病毒芯片。阿强和阿娟在黑狼投资的电影的片场相遇,阴差阳错之下,储存着制作变异病毒方程式的芯片落在了不知情的阿强的口袋里……阿娟和三哥的身份被黑狼识破,黑狼绑架了阿娟逼三哥交出病毒芯片,医学博士已成功研发出初代病毒,重重危机令三人陷入绝境……。十七岁的农村少年阿贵在北京找到一份送快递的工作,并且得到许诺,当他赚到六百块时,便可以拥有公司暂借他的银色变速越野车。他每天勤奋工作,就在梦想即将成真时,单车丢了,阿贵陷入绝望。
小坚是和阿贵同岁的北京少年,但因家庭贫困,他维系骄傲又时常自卑。父亲许给他一辆单车的承诺屡次食言后,小坚从家里偷钱买了一辆二手车。不成想这辆车正是阿贵所丢,阿贵发现后,开始不计代价拼命讨回,两个少年为守护自己简单的梦想发生争斗。。故事发生在风景如画的清湖边上,水源的短缺一直是困扰村庄的最大问题,而掌握着水源命脉的万家庄庄主万大权,以水源为筹码,要挟赵时俊(寇世勋 饰)娶他体弱多病的女儿秋玲。然而,赵时俊和名为沈心慈(沈海蓉 饰)的女子早已经两情相悦,沈心慈腹中还怀上了赵时俊的孩子,可是,为了村庄的未来,赵时俊只得答应了万大权的要求。
沈心慈生下了女儿取名为绣云(沈海蓉 饰),得知此消息,失去理智的赵时俊决心不惜一切代价也要给沈心慈一个名分,然而,最终,沈心慈却死在了李耿明(李志坚 饰)的手上。在秋玲的悉心照料和陪伴之下,崩溃的赵时俊重新振作了起来,殊不知,一场巨大的灾难即将降临在小镇之上。。