来自外星的约翰·史密斯为了躲避杀戮逃到地球,他是幸存的九个青少年之一,并是其中的第四号。没想到追杀者也追踪到了地球,前三号已经死在他们手中,约翰则是下一个目标。这时约翰已经和自己的保护者逃亡到了天堂镇,邂逅并爱上了美丽的女同学萨拉。。天才物理学家汤川学此次又受内海薰所托,调查一件不可思议的命案。受害人富樫慎二被发现死在河边,面目指纹尽毁。最大的嫌疑人是他的前妻花冈靖子,然而靖子却有着完美的不在场证明。一个人能够同一时间出现在不同地方吗?当汤川发现住在靖子隔壁的是当年的大学同学、同为天才的数学家石神哲哉时引起兴趣。
毕业后因要照顾父母没有留校反而去高中教数学、一直生活得很落魄的石神每晚利用公用电话教靖子如何应对警察追查,靖子渐渐感到被束缚,但是由于给出的口供毫无可疑之处,警察决定放弃对靖子的调查,这时汤川却指出石神是关键人物。
案件的真相如何?世界上真有一个人同时出现在两个地方的事情吗?。新一季将聚焦2001年美国炭疽攻击事件,该事件是在美国发生的一起从2001年9月18日开始为期数周的生物恐怖袭击。从2001年9月18日开始有人把含有炭疽杆菌的信件寄给数个新闻媒体办公室以及两名民主党参议员。这个事件导致五人死亡,17人被感染。直到2008年最主要的嫌疑人才被公布。金大贤饰演一名擅长微生物学的FBI特工,戈德温饰演一名陆军生物学家,该角色根绝真实人物布鲁斯·艾文斯的经历改编。。