进入了明治时代,曾经的“刽子手拔刀斋”绯村剑心(佐藤健 饰)已经习惯了神谷道场的安宁生活。谁知就在这一天,倒幕战争时的旧友——号称维新三杰之一的大久保利通(宫泽和史 饰)将其请去。原来继承了剑心刽子手身份的志志雄真实(藤原龙也 饰)当年被新政府背叛,侥幸活下来的志志雄正秘密筹措称霸日本的可怕计划。大久保死后,深感背负不可推卸责任的剑心只身上路,在途中不仅偶遇京都女忍卷町操(土屋太凤 饰),还在新月村和志志雄有了第一次的遭遇。与此同时,相乐左之助(青木崇高 饰)、神谷薫(武井咲 饰)、明神弥彦(大八木凯斗 饰)、斋藤一(江口洋介 饰)也相继赶往京都。阴云密布的时代,酝酿着一场席卷全国的风暴……
本片根据和月伸宏的经典漫画原作改编。。公元1840年鸦片战争以后,不堪忍受清朝残酷压榨和外国侵略的各地中国人民,纷纷起来英勇抗争。其中以洪香全为首的"天帝会"势力最大。其于1851年在广西金田村起义,定国号为"太平天国"。 义军起义后的两年就席卷长江,截断了清朝的漕运,攻下南京.太平天国定都于此改称天京。清朝启用汉族名家曾国藩编练的湘军以击太平天国,无奈前后湘军均大败。曾国藩自杀。太平天国同时也把略者打得一败再败,不敢见仗。然而偏安东南,孤军北伐,天京事变,使得太平天国大好形势骤然跌入谷底。 东王杨秀清日益骄纵,觊觎天王宝座,北王韦昌辉借力杀人|而洪秀全也私心颇重,使得北王杀骨干两万余人|翼王石达开被迫带兵分道扬镳,牺牲在大渡河畔.此后,虽然有陈玉成,李秀成的艰苦奋斗,但至终敌不住中外统治者疯狂进攻,1864年洪秀全病逝,太平天国也随之瓦解…..。